En 2012, tous les êtres de sexes masculin ont été décimés à la suite de la contamination d’un gène. L’espèce humaine est donc en voie d’extinction car si quelques femmes restent encore en vie, elles n’auront évidemment aucune descendance. Les survivantes sont alors partagées entre les résignées qui veulent profiter de leur vie et celles qui cherchent n’importe quel moyen pour assurer la survie de l’humanité. C’est alors qu’un nouvel espoir apparaît avec l’échantillon ICE....

À bord d'un luxueux bateau, Conan et toute sa petite troupe au grand complet voguent au grès de cette paisible croisière. Bien évidement, un évènement viendra rapidement briser cette utopique félicité : le meurtre de l'un des passagers. Cet incident déclenchera une réaction en chaîne allant crescendo jusqu'à mettre en péril la vie des 600 passagers....

Deux races ennemies, les Solnoids, des humanoides féminines se reproduisant par clonage, et les Paranoids, des fluides dotés de conscience habitant des corps mécaniques; se livrent une guerre sans pitié depuis des générations. Survivant de justesse à une bataille spatiale titanesque, un groupe de sept Solnoids met le cap vers Chaos, un monde vierge devant servir de nouvelle patrie pour leur race. Mais les ennuis ne font que commencer pour les survivantes....

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Une jeune fille du nom de Sakura demande de l'aide à Cure Whip, ainsi que d'autres PreCure afin de l'aider à sauver son ami Shizuku, un renard ayant été kidnappé par le démon Karasutengu...