Seth Brundle est un jeune biologiste très doué. Après avoir fait ses premières armes dans une brillante équipe, il se décide à travailler seul. Il met au point une invention qui doit révolutionner le monde : la "téléportation" qui consiste à transporter la matière à travers l'espace. Les essais sur un babouin sont peu convaincants et après des fuites dans la presse, il décide de se téléporter lui-même. Seulement il ne s'apercoit pas qu'une mouche fait partie du voyage....

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Le Dr Blakely dirige une émission de télévision appelée "penseurs indépendants", qui propose un programme religieux d'entraide à la Scientologie. Mais n'ayant que peu d'audition, il fait appel à un organisme étranger indépendant appelé "le cerveau". Il utilise le lavage de cerveau et le contrôle de l'esprit.pour dominer le monde. La seule chose qui se dresse entre eux est un étudiant brillant ayant un penchant pour les farces....