Pour augmmenter la popularité d'une petite île, et pour attirer des visiteurs dans le but de pouvoir la sauver, une équipe de Water boys va être créée, aidée par un des membres de la seconde épopée....
L'histoire se déroule un an après le premier film. On y suit les deux survivants rentrer chez eux et tenter d'alerter l'opinion publique sur ce qui s'est passé sur l'île. Leurs déclarations provoquent un chaos sur tout le pays, violemment réprimé par le pouvoir militaire. Ce dernier décide alors de faire participer les deux opposants à la deuxième session de Battle Royale en compagnie d'une classe beaucoup moins tendre que la précédente....