47 ans se sont écoulés depuis l'apparition de Godzilla et aujourd'hui, le grand monstre est de plus en plus considéré comme une simple légende. Mais d'étranges disparitions de navires commencent à se produire et bientôt, leur origine ne fait plus de doute : Godzilla est de retour pour réduire le Japon en miettes. Au même moment, Yuri, une jeune journaliste, rencontre un vieux prophète qui lui annonce que le combat ultime pour la survie du pays est sur le point de commencer. Car cette fois, le Japon n'est pas sans défense face au roi des monstres : Baragon, Mothra et King Ghidorah, ses monstres protecteurs, vont sortir de leur sommeil pour tenter de le vaincre. Et personne ne sortira indemne de la « battle royale » qui s'annonce......

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Un procureur de Tokyo, accusé de vols, s'échappe pour blanchir sa réputation. Un policier part à sa poursuite....

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Japon, 1932. Après la mort de leur maître, deux élèves s'engagent sur deux voies radicalement différentes. L’un obéit à la lettre aux préceptes de son maître et se contente de contrer les coups de ses adversaires. L’autre ne comprend pas la pertinence d’apprendre à se battre pour simplement parer les attaques. Il n’hésite pas à frapper le premier. Alors que le second mène la police militaire japonaise dans des raids contre les dojos, le premier cherche à défendre les faibles et à déjouer les machinations d’une bande de proxénètes. Leurs parcours de croiseront de nouveau et permettra de savoir qui est le digne héritier du maître, capable de porter la ceinture noire.......

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Deux ans après le précédent épisode, une affaire importante se produit qui a le potentiel de faire tomber l’organisation de la police toute entière. L’inspecteur de police Aoshima et ses collègues vont avoir trois jours pour tenter de démêler l’affaire…...

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Sayaka travaille dans un bureau. Elle n'assure pas vraiment dans son boulot ni dans sa vie sentimentale. Une nuit, elle trouve une jeune homme, Itsuki, effondré devant chez elle. Elle le fait entrer et ils commencent à vivre ensemble. Itsuki enseigne à Sayaka la cuisine et la collecte des herbes sauvages mais il a un secret....

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Daisuke Yuge travaille comme guide touristique à Hawaï et étudie également l'astronomie. Il rencontre Rui Fujishima dans un café et c'est un coup de foudre. Mais Rui Fujishima souffre de pertes de mémoire à la suite d'un accident passé....

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Le film se concentre sur le cours de la Seconde Guerre mondiale, de l'attaque de Pearl Harbor à sa fin, et le procès ultérieur de criminels de guerre. Principalement concentré sur la figure de Hideki Tojo, qui est progressivement devenu l'homme le plus puissant du pays, et finalement la responsabilité du début de la guerre avec les États-Unis lui est imputée....

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