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Le film est composé de trois chapitres, chacun d'entre eux étant librement inspiré par Tokyo et tourné au cœur de la ville... "Interior Design" de Michel Gondry : un jeune couple se noie dans cette ville sans repères, jusqu'à ce que la jeune femme, trop seule, devienne l'objet d'une étrange transformation... "Merde" de Leos Carax : Une ignoble créature sème la panique et la mort dans les rues de Tokyo. Son procès déchaîne les passions... "Shaking Tokyo" de Bong Joon-ho : Depuis plus de dix ans, il est hikikomori. Il vit enfermé dans son appartement, réduisant au strict minimum tout contact avec le monde extérieur. Lorsque la livreuse de pizzas s'évanouit chez lui durant un tremblement de terre, l'impensable arrive, il tombe amoureux....

Trois ans après la disparition tragique et volontaire des membres d'une secte obscure, quatre amis, tous parents de victimes, se retrouvent le jour anniversaire de la tragédie sur les lieux même où celle-ci a commencé : un endroit paisible et reculé, une petite maisonnée coincée entre la forêt et l'eau reposante d'un lac. En chemin, ils croisent Sakata, un jeune homme qui appartenait à la secte... et qui l'a quittée juste avant le massacre. Le pèlerinage va alors prendre une tournure inattendue....

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