Tout commence par Denzel qui raconte son histoire pendant un entretien pour intégrer le WRO, son histoire retrace les évènements du jeux vidéo Final Fantasy VII jusqu'au film Final Fantasy Advent Children. Pendant ces évènements on retrouve, la destruction du secteur 7 où habitait Denzel (engendrée par la Shinra), le moment où le météore s'abat sur Midgar, l'apparition du Geostigma (maladie causé par un contact avec la Rivière de la Vie), la construction de la ville de Edge à partir des débris des Taudis, et sa rencontre avec Cloud, Tifa et Marlène....

Après avoir quitté le camp d'Ōzen, Riko et Reg poursuivent leur voyage, faisant face à davantage de dangers alors qu'ils descendent plus loin dans les Abysses....

« Abyss », un lieu intriguant et nimbé de mystère. Un trou béant, seul lieu inexploré du monde. Un endroit fascinant et dangereux. Rico, jeune orpheline, a grandi dans une petite ville située au bord du gouffre tout en rêvant de devenir Cave Raiders, comme sa mère. Un jour, alors qu'elle se décide à entrer dans l'Abyss, elle rencontre un étrange robot qui ressemble à s'y méprendre à un être humain....

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Natsu et ses amis partent exécuter un petit boulot. Mais, à cause d’une erreur de la part de Lucy, la mission est un échec. Sur le chemin de retour vers son appartement, Lucy rencontre une fille nommée Éclair, écroulée au sol. Cette fille, accompagnée d’un oiseau nommé Momon, a, semble-t-il, perdu la mémoire et tout ce dont elle se rappelle est qu’elle doit livrer la moitié de la pierre de Phœnix, en sa possession, quelque part. Les ennuis ne tardent pas à arriver pour Fairy Tail. En effet, la garde d’un prince capricieux convoite la pierre qu’Éclair possède. La guilde est pratiquement détruite et Éclair est enlevée. La guilde Fairy Tail ne tarde pas à partir au secours de la demoiselle et à s’engager dans des combats difficiles contre les quatre gardes… au prix d’un sacrifice....

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