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Char tente de prendre possession de l'astéroïde Luna 5 durant la bataille de Gryps. Mission réussie, il parvient à le faire lancer sur Lhassa, au Tibet, là où se trouvait le nouveau QG de la Fédération. Adenauer Paraya, un politicien envoyé par la Fédération, a pour mission de négocier secrètement avec Char Aznable afin qu'il n'y ait plus de conflit. La négociation tourne à l'avantage de Char qui rachète l'astéroïde Axis à l'aide d'une très forte somme en or. Son plan, projeter Axis sur Terre pour anéantir toute vie dessus et accélérer l'évolution de l'humanité en NewTypes. Bright Noah, Amuro Ray, et tous les membres de Londo Bell devront alors tout faire pour empêcher cette catastrophe....

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La baie de Tokyo est le théâtre de tragiques événements. Plusieurs accidents s'y produisent et l'origine du phénomène qui les cause demeure encore un mystère. Les agents Kusumi et Hata, chargés d'élucider cette sombre affaire, s'aperçoivent que les diverses victimes sont à la fois les hommes et les Labor, ces gigantesques robots mis au point par les entreprises de construction japonaises à la fin du siècle et qui permettent d'effectuer de cyclopéens travaux d'aménagement....

Le film se déroule après la fin de l'animé. L'équipe japonaise de football part en stage en Europe pour sélectionner les meilleurs joueurs qui participeront à la prochaine Coupe du Monde ! Là-bas, on retrouvera le formidable gardien de but Thomas Price et aussi le meilleur ami d'Olivier, Ben Becker, qui formait jadis avec lui le tandem d'or…...

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Ce film se déroule après la fin du dernier championnat opposant la Muppet et la Newteam. L'équipe nationale junior de football du Japon, dont fait partie Olivier Atton (Tsubasa), part pour jouer un match amical en Europe et plus précisément à Paris, pour défier une équipe composée des meilleurs éléments européens avec un certain Karl Heinz Schneider, le capitaine de l'équipe d'Allemagne, l'un des meilleurs joueurs du monde ! Les Japonais seront-ils à la hauteur pour affronter cette redoutable équipe ?...

Après un match très disputé en France, le Japon et l'équipe européenne s'affrontent une nouvelle fois pour le match retour, mais cette fois-ci sur les terres nippones ! Les Japonais arriveront-ils à prouver encore que leur place sur l'échiquier mondial du football est parmi les meilleures nations du monde ?...