Kunisaki Yukito est un jeune homme qui gagne sa vie grâce à des spectacles avec sa marionnette qu'il contrôle sans fils. Il parcourt le monde à la recherche d'une fille ayant des ailes lui permettant de voler, poursuivant ainsi le rêve de sa mère. Un jour il arrive dans un village et fait la rencontre de Misuzu, une jeune fille bizarre et naïve. La mère de celle-ci, une "adulte" irresponsable, accepte qu'il loge chez elles s'il s'occupe de Misuzu et plus particulièrement de son reflexe : elle dit tout le temps "Gao" et cela l'énerve. Il rencontre aussi Kano Kirishima, une fille mystérieuse qui dit pouvoir utiliser la magie et dont le meilleur ami est un adorable chien apellé Potato, ainsi que sa grande soeur qui tient la seule clinique du village. Il y a aussi Minagi, la premiere de la classe et son amie Michiru, une enfant pour le moins turbulante. Il va décider de rester quelque temps dans ce village où le rêve de beaucoup semble être de voler dans le ciel......

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L'aventure fait place à l'action avec l'apparition de Mewtwo, un Pokémon de laboratoire créé avec l'ADN de Mew, l'un des Pokémon les plus rares qui soient. Après s'être échappé du laboratoire, Mewtwo est déterminé à prouver sa supériorité : il invite les meilleurs Dresseurs à un combat de Pokémon sans pareil, et bien sûr, Sacha et ses amis sont ravis de relever le défi. L'enthousiasme de Sacha se transforme en colère lorsque Mewtwo décide de cloner les Pokémon des enfants et rétablir l'équilibre entre les Pokémon et leurs Dresseurs. Malgré Sacha, Mewtwo refuse de croire que Pokémon et humains peuvent être amis. Mais face à un jeune Dresseur et à la loyauté de son Pokémon, Mewtwo devra changer de plan et se mesurer à la puissance du mystérieux Mew !...

Cet épisode se déroule avant que Mewtwo ne rencontre Sacha et ses amis dans Genesect et l'éveil de la légende. L'incroyable vitesse et la capacité de combat de Méga-Mewtwo Y sont pour la première fois révélées, mais pas son nom réel. Possédant une incroyable puissance, il souhaite ne pas croiser les chemins des humains et des Pokémon....

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Le film de clôture de la quadrilogie finale....

Le deuxième film de la quadrilogie finale....

Alors que Fu et ses amis entament leur troisième et dernière année de lycée, le club de photographie accueille deux nouveaux membres : Takumi Shindou, en première année, et Suzune Maekawa, en deuxième année. En réfléchissant à ce qu'elle fera après son diplôme, Fu décide de poursuivre une carrière combinant la photographie et les voyages....

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À bord d'un luxueux bateau, Conan et toute sa petite troupe au grand complet voguent au grès de cette paisible croisière. Bien évidement, un évènement viendra rapidement briser cette utopique félicité : le meurtre de l'un des passagers. Cet incident déclenchera une réaction en chaîne allant crescendo jusqu'à mettre en péril la vie des 600 passagers....

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On retrouve Jimmy et son Typhlosion dans leur voyage Pokémon. Non loin d'ici, Attila et Hun arrivent sur une base de la Team Rocket pour voir le cristal miracle. Cette invention peut stocker de l'énergie électrique et attirer les Pokémon Électriks. Jimmy rentre dans un Centre Pokémon et retrouve son amie Marina, En ressortant du bâtiment, ils rencontrent la Team Rocket avec le cristal miracle. Attila et Hun l'utilisent pour attirer tous les Pokémon électriques et capter leur énergie. Avant que Jimmy et Marina ne puissent les arrêter, un autre coup de foudre signale l'arrivée du légendaire Raikou......

Dans une grande ville, à bord d'un ascenseur, Pikachu remarque un Pichu lui tirant la langue au loin, le Pokémon de Sacha fait de même. Une fois arrivés à destination, et alors qu'ils sortent tous leurs Pokémon, Sacha, Pierre et Ondine les laissent vaquer pendant qu'ils sont occupés à autre chose. Sur le toit d'un immeuble, les Pokémon du Pokégroupe s'amusent, Pikachu repère alors le Pichu vu plus tôt qui continue à se moquer de lui. Le Pichu moqueur est sur le point de tomber mais son frère le récupère, c'est alors au tour de Pikachu de se rattraper de justesse grâce au concours de Granivol et de Miaouss. Cette aventure fait que Pikachu arrive de l'autre côté de la rue et les Frères Pichu décident de l'aider à retrouver ses amis. Malgré leur connaissance de la ville, les petits Pokémon Électrique attirent plein d'ennui à Pikachu durant le trajet. Ils rencontrent un Malosse qui n'apprécie pas de se voir atterrir dessus. Les Pichu attaquent le Pokémon Feu mais s'électrisent eux-mêmes....

Une catastrophe de cristal s'attaque à Greenfield... Sacha, Pikachu et leurs amis doivent trouver une solution pour réparer les dégâts causés à cette ville jadis si élégante. Mais l'impensable se produit quand la mère de Sacha est enlevée par le puissant Entei, un Pokémon qui était censé n'exister qu'en légende... Sacha doit partir à sa rescousse, sans savoir ce que cachent réellement ces événements incroyables : une jeune fille dont le rêve est transformé en cauchemar par des Zarbi mystérieux et inarrêtables....

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Pokémon : Évoli & ses amis est un court-métrage qui accompagne le film 16: Genesect et l'éveil de la légende. Il présente le Pokémon Nymphali....

Une météorite s'écrase sur la Terre, libérant Deoxys, visiteur de l'espace. Rayquaza, gardien de la Terre, descend exceptionnellement sur notre planète pour tenter désespérément de détruire Deoxys... Sacha et ses amis vont se retrouver malgré eux au beau milieu de cette bataille de titans !...

La légende dit qu'autrefois, Aaron, l'Aura Gardien, aidé de son Pokémon Lucario, réussit à arrêter une terrible guerre. Au Palais Cameran, les habitants organisent chaque année un tournoi Pokémon pour le célébrer. Sacha y participe et gagne, obtenant ainsi le titre d'Aura Gardien. Mais le Pokémon légendaire Mew apparait alors et kidnappe Pikachu ! Lucario fait irruption et emmène Sacha et ses amis dans un périple à destination du mystérieux Arbre des Origines qui est protégé par les Golems Regirock, Regice et Registeel....

Autrefois, le Peuple des Mers construit un temple et y cacha un trésor : la Couronne des Mers. De nos jours, Sacha et Pikachu rencontrent Lizabeth, descendante du Peuple des Mers et Jackie, Pokémon Ranger chargé de protéger un oeuf de Manaphy et de trouver le Temple. Soudain, les voilà attaqués par Fantôme le pirate qui projette de conquérir le monde et voler la Couronne des Mers, mais pour cela il a besoin de cet oeuf....

Après qu'une expérience scientifique ait conduit à la création d'un clone de Mewtwo, il entreprend de détruire le monde. Ash et ses amis décident alors de déjouer les plans diaboliques de Mewtwo......

Mewtwo vit avec les pokémons clones dans lieu magique et préservé des humains de la région de Johto. Mais Giovanni est sur le point de le retrouver....

Le Monde inverse est un monde contrôlé par Giratina. Le combat qui avait opposé Dialga et Palkia a créé une fissure. Giratina décide alors de se venger sur Dialga. Et comme d'habitude Sacha, Pikachu et leurs amis sont de la partie....

Dans ce film special "10 ans de Pokemon", le docteur Yung a mis au point un systeme qui lui permet de recreer n'importe quel Pokemon ayant existe grace a une technologie generant des "Pokemon Mirages". Sacha et ses amis sont invites a decouvrir l'invention dans un chateau ... mais ce qu'ils vont decouvrir est bien pire qu'ils ne l'imaginaient....

Kindaichi, Miyuki et Fumi sont invitées à la station balnéaire de l'île bleue profonde par leur senpai Akane, la fille du président du groupe Aizawa. Un groupe de criminels s'infiltre dans l'hôtel en tant que serveurs pour tuer les membres du groupe Aizawa. Les criminels ne connaissent pas leur patron en personne, et ils ne savent pas non plus qu'il se trouve dans l'hôtel avec les membres du Groupe Aizawa....

Alice Miller, officier du génie militaire de la Fédération, est officiellement affectée à l'examen des restes de l'Apsalus, le prototype d'un mobile armor de Zéon détruit dans le Sud-Est asiatique au cours d'une mission de la 8ème équipe de mobile suits. Mais en réalité Alice Miller est un agent des services secrets chargé de déterminer si Shiro Amada, le chef de la 8ème équipe, est un espion à la solde de l'ennemi… Son enquête l’amènera à bouleverser considérablement les convictions du jeune officier persuadé que même les soldats ennemis ne devraient pas être tués sans nécessité....

Sacha et Pikachu s'apprêtent à vivre le plus grand combat Pokémon de tous les temps. Palkia et Dialga s'affrontent, créant de terribles dégâts et le mystérieux Darkrai rode....

C'est l'automne et la ville de Neo-Venezia est couverte de feuilles mortes. Quelque chose dérange Anya, qui travaille à Orange Planet. Ses collègues plus âgées, Alice et Athena, ne se sont pas vues en raison de leurs emplois du temps chargés, ce qui rend Athena triste. Mais Alice semble l'éviter complètement. Avec l'aide de ses amies Ai et Azusa, Anya tente de trouver un moyen définitif pour qu'Alice et Athena se retrouvent....