Ghost in the Shell : Arise est un ensemble de 4 films qui racontent l'histoire de Mokoto Kusanagi et de comment elle a rejoint la section 9. On la découvre plus jeune, depuis sa précédente occupation jusqu'au recrutement de l'ensemble des membres de son équipe. Celui ci est la suite directe de Ghost in the Shell: Arise - Border...

Nous sommes en 2027 soit un an après la fin de la guerre-non nucléaire. Une ville relativement paisible appelée New Port est attaquée par des terroristes. L’armée japonaise décide de répliquer en postant son armée en plein cœur de New Port. Mais les terroristes frappent à nouveau. Une enquête est ouverte par le gouvernement nippon et celle-ci est confiée à la section 9 dirigée par Daisuke Aramaki. Afin de renforcer son effectif, le leader de la section 9 a intégré à son équipe un nouveau membre : une jeune demoiselle répondant au nom de major Motoko Kusanagi....

Kusanagi et Bâto enquêtent sur les agissements d'une organisation terroriste dont le symbole est une Scylla. Togusa enquête de son côté sur le meurtre d'un homme qui transportait des jambes artificielles fabriquées par la Mermaid's Leg corporation....

Kusanagi et toute la section 9 doivent débusquer un terroriste connu sous le nom de "Fire Starter" qui libère un virus affectant les cyber cerveaux....

Mars 2029. Dans un monde en phase de cybernétisation accélérée, les Etats souverains sont désormais dépassés par les flux d'informations et affaiblis par l'émergence de nombreux groupuscules se livrant une lutte de pouvoir effrénée. Le Premier Ministre du Japon est alors brutalement assassiné. Motoko Kusanagi, une cyborg d'élite à la tête de la Section 9, est chargée de découvrir la vérité. Une enquête très dangereuse sur les traces d'un cyber-virus d'une ampleur sans précédent l'emmènera à questionner ses origines ainsi que le rôle grandissant de la technologie dans un monde encore vulnérable.....

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Réalisant son rêve d'enfant, Kisaragi Reina fait ses débuts d'idole. Cependant, elle a de grandes aspirations professionnelles et son chemin vers le succès est difficile. Elle est relativement inconnue dans l'industrie, et ses jours d'obscurité relative et de peu de travail se poursuivent. Elle ne sait pas ce qui la différencie des idoles de son agence de talent qui ont plus de succès. Elle en parle directement à son producteur. Reina essaie de ne pas montrer sa colère et son impatience, et son producteur, bien que réticent à faire des efforts, lui dit : "Je vais vous trouver une connexion. Le reste dépend de vous". Reina se méfie de son ton dédaigneux, mais elle rencontre un homme qui est un haut responsable de l'industrie. Une tenue incontestablement sexy, des gens qui la déshabillent du regard... Que doit faire une idole pour réussir dans l'industrie ?...

Motoko et son équipe se rapprochent enfin du courtier de Fire-Starter, mais les choses deviennent tendues lorsqu'on leur demande de jouer un rôle en retrait dans une opération d'infiltration....