Dans un Japon post-apocalyptique déchiré par une guerre sans fin, un groupe composé de 3 hommes et d'une femme lutte pour maintenir ouvert un hôpital de campagne. Après la mort du médecin, alors que la fermeture de l'hôpital vient juste d'être ordonnée, débarque une unité militaire dont la mission semble être l'acheminement d'un étrange paquet. Attaqués par une étrange créature ayant blessé l'une des leurs, ils vont devoir passer la nuit à l'hôpital …...

Un soir ordinaire dans un bar. Sai, un apprenti yakuza, a le coup de foudre pour Sheila, la petite amie du chef du clan Kurogane. Mais la belle disparaît trois jours après, pour ne réapparaître que 342 jours plus tard, déclarant que leurs destins sont liés. Sous le charme, le jeune homme décide de la suivre, malgré les risques......

Yamata, Jinnai et Nezumi, trois ninjas de la province d’Iga, sont occupés à mettre en déroute des adversaires plus proches de l’esclave SM que du shinobi, de retour d’une mission au cours de laquelle Yamata a fait preuve d’excès de zèle en faisant sauter le palais où il devait se contenter de quelque espionnage, lorsqu’ils voient une singulière boule de flamme traverser le ciel. Chargés par leur maître d’en savoir plus, et flanqués d’une autre équipe de guerriers menés par la belle Rin, eux aussi témoins du phénomène, les ninjas vont se retrouver aux prises avec de belliqueux extraterrestres…...

Suite à sa survie de son exécution, un condamné à mort accepte de participer à une expérience. Le gouvernement en profite alors pour tester un nouveau virus extraterrestre......