Sean Barker est le possesseur d'une étrange armure extraterrestre, le Guyver, qu'il utilise pour rendre la justice. Il apprend un jour que des archéologues ont mis au jour des vestiges montrant des symboles identiques à ceux du Guyver. Pour en savoir plus, Sean se rend sur place. Il fait la connaissance de Cori Edwards, la fille du professeur Marcus Edwards, responsable des fouilles. En visitant le site, Sean entend un homme crier et se retrouve face à un Zoanoid, créature hostile d'un autre monde, qui réussit à prendre la fuite. Poursuivant ses investigations, il va découvrir beaucoup de choses au sujet de son armure et de ceux qui la convoitent......

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