Depuis son combat contre le Pteracuda, le sharktopus est toujours au large et rôde ce coup-ci du côté de la République Dominicaine. Ray, un capitaine de bateau un peu alcoolique sur les bords, et son acolyte Pablo, sont engagés par un prêtre vaudou afin de tuer le Sharktopus et de lui ramener son cœur. Mais pendant ce temps, une scientifique un peu dérangée du ciboulot va donner « naissance » par erreur à un spécimen mi baleine mi loup. La rencontre des deux monstres s’annonce bestiale…...

Après la découverte de l’ADN d’un ptérodactyle, le Dr Rico Symes combine ce dernier à celui d’un barracuda, créant ainsi un monstre capable de terroriser terre, mer et air. Il perd le contrôle de sa créature et ne trouve qu’une solution ultime : lui opposer le nouveau Sharktopus. Un combat titanesque s’engage...