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Kamokawa Yoshiro se réveille un matin avec la capacité d'entendre les pensées des gens qui l'entourent. Depuis cette mystérieuse nuit, plusieurs personnes de son entourage disposent d'ailleurs de pouvoirs psychiques. Ainsi Miyuki, une camarade de classe de Yoshiro dispose du même pouvoir que lui et Terumitsu, le patron obsédé d'un café qu'il fréquente régulièrement, est devenu capable de télékinésie. Le professeur Asami qui effectue des recherches sur ces pouvoirs rassemble Yoshiro et d'autres espers, prévoyant qu'une bataille féroce pourrait s'engager avec d'autres espers aux intentions malveillantes. Et de fait, la ville commence à être plongée dans le chaos....

C’est une journée ordinaire qui commence pour Shun Takahata, dont la vie est si banale qu’il s’est mis à la trouver ennuyeuse. Ce lycéen de 16 ans, plutôt discret, voit son quotidien paisible voler en éclats en même temps que la tête de son prof, en plein milieu du cours ! Lui et ses camarades de classe se retrouvent soudain otages du jeu sanglant mené par une étrange figurine... Il va lui falloir survivre ! Mais cette épreuve est-elle une punition divine, ou un cadeau ?...

Une mystérieuse créature détruit 70 % de la Lune. La créature prévient alors que si elle n'est pas détruite avant le mois de mars de l'année prochaine, il détruira la Terre. La créature exige aussi de devenir le professeur principal pour la 3e classe E à Kunugigaoka Junior High School. Le gouvernement ne peut refuser. La créature devient alors le professeur principal de la classe qui se compose d'étudiants ayant échoué, y compris Nagisa Shiota. La créature est appelée Teacher Koro. Pendant ce temps, le gouvernement demande aux étudiants de tuer le Maître Koro qui a promis de ne pas leur faire de mal....

Quand la belle Kanako, lycéenne populaire et sans histoire disparaît, sa mère fait appel à son ex mari, flic alcoolique, pour qu’il retrouve leur fille. Mais celui-ci va découvrir que sous les apparences, l’univers de l’adolescente est plus trouble qu’il n’y paraît…...

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