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Dix ans après le retour du vaisseau spatial Voyager du Quadrant Delta , la Fédération est en crise. Les principaux fournisseurs de cristaux de dilithium de la Fédération (le principal catalyseur du carburant utilisé pour les déplacements plus rapides que la lumière ) disparaissent. L'espace et le temps se sont repliés autour de plusieurs planètes, les isolant de tout contact extérieur. Le phénomène n'est pas naturel - quelqu'un ou quelque chose le provoque. L'amiral Pavel Chekov , chef de Starfleet Intelligence , se tourne vers le commandant Tuvok , ancien officier de sécurité du Voyager et actuel chef de la section 31 nouvellement réorganisée , l'organisation autonome de renseignement et de défense de Starfleet. Tuvok doit mettre sur pied une nouvelle équipe secrète de renégats. Ce nouvel équipage est chargé de découvrir ce qui cause le repliement du temps et de l'espace, et de l'arrêter à tout prix....