L’histoire nous entraîne au côté de Makoto Makazono, un lycéen capable de voir les shinigami qui volent les âmes des vivants.Habitué à y faire abstraction, Makoto se retrouve devant un dilemme quand son amie d’enfance se retrouve être la cible de l’un d’entre eux....

Dans la guerre du Saint-Graal, les mages (Masters) et leurs Esprits Héroïques (Servants) se battent pour le contrôle d’une machine à vœux omnipotente. Des années se sont écoulées depuis la fin de la cinquième guerre au Japon. Aujourd'hui, des signes annoncent l'émergence d'un nouveau Saint-Graal dans la ville de Snowfield, à l'ouest des États-Unis. Les Masters et leurs Servants se rassemblent sur place......