Le film se focalise sur les origines d'Ultraman qui devient ami avec un petit garçon appelé Musashi. Il est basé sur la série télévisée Ultraman Cosmos et a pour suite Ultraman Cosmos 2: The Blue Planet puis Ultraman Cosmos vs Ultraman Justice: The Final Battle....

Masao s'ennuie. Il habite Tokyo avec sa grand-mère qui travaille toute la journée. Grâce à une amie de cette dernière, Masao rencontre Kikujiro, un yakusa vieillissant avec lequel il part à la recherche de sa mère, qu'il ne connait pas et qui vit au bord de la mer....

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