Durant l’ère Edo, deux clans convoitent mutuellement l’épée Ginryu, l’un des biens les plus précieux de la famille Sugawara. Shuranosuke Sakaki, un jeune homme expert en sabre mais de caractère austère et distant, accepte d’aider le clan Nakura à délivrer la princesse Mayu, retenue en otage par le clan ennemi en échange de l’épée Ginryu....

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À des milliers d’années-lumière de la Terre se trouve la galaxie du Joker, constituée de 4 étoiles autour desquelles gravitent de nombreuses planètes. Sur Bastogne, 2 hommes font connaissance : Vord Bewlard, un chauffeur routier d’apparence ordinaire, et Ladios Sopp, un jeune homme d’allure androgyne que Vord prend d’abord pour une fille. Ladios est en réalité un talentueux Meister, un concepteur d'engins de guerre intelligents appelés Mortar Headd. Ces Mortar Headd ne peuvent être pilotés que par un Headd Liner et sa Fatima, un androïde d’apparence généralement féminin conçu à partir d’ADN humain…...

La forteresse SDF-1 revient vers la Terre, poursuivie par des guerriers géants. Au cours d'une attaque, un jeune pilote, Hikaru Ichijô, sauve la célèbre chanteuse Lynn Minmay. Ils se lient d'amitié Hikaru l'emmène au cours d'un vol d'entraînement mais ils se font capturer…...

En l'an 2161, Joe est à la tête des Crusher, un groupe de durs à cuire au service de l'Union Spatiale qui leur confie les travaux pas très honorables, voire illégaux. Pour être couverts, ils doivent impérativement réussir chaque mission…...

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