L'aventure fait place à l'action avec l'apparition de Mewtwo, un Pokémon de laboratoire créé avec l'ADN de Mew, l'un des Pokémon les plus rares qui soient. Après s'être échappé du laboratoire, Mewtwo est déterminé à prouver sa supériorité : il invite les meilleurs Dresseurs à un combat de Pokémon sans pareil, et bien sûr, Sacha et ses amis sont ravis de relever le défi. L'enthousiasme de Sacha se transforme en colère lorsque Mewtwo décide de cloner les Pokémon des enfants et rétablir l'équilibre entre les Pokémon et leurs Dresseurs. Malgré Sacha, Mewtwo refuse de croire que Pokémon et humains peuvent être amis. Mais face à un jeune Dresseur et à la loyauté de son Pokémon, Mewtwo devra changer de plan et se mesurer à la puissance du mystérieux Mew !...

Taeko, une jeune citadine de 27 ans, part en vacances à la campagne dans la famille de son beau-frère. Laissant derrière elle ses préoccupations professionnelles, elle se laisse submerger par ses souvenirs d'enfance, des anecdotes survenues en 1966 alors qu'elle n'avait que onze ans !...

Shizuku est une jeune collégienne de quatorze ans comme toutes les autres, mais elle est passionnée de littérature et elle écrit des chansons. C’est l’été à Tokyo, et elle a décidé de lire, pendant les vacances, une vingtaine de livres. Elle découvre qu’à chacun des romans qu’elle a choisis, le nom de Seiji Amasawa apparaît sur la liste des personnes les ayant empruntés. Shizuku rencontre enfin ce Seiji....

Hitomi est une solitaire, mal dans sa peau. Consciente de faire souffrir son entourage, elle voudrait juste disparaître. Comme un ange venu exaucer son vœu, un homme encapuchonné lui apparaît et lui prédit la réalisation de son souhait. Aspirée par de l’eau apparue comme par magie, elle reprend connaissance dans un autre monde, à l’intérieur du cockpit d’Escaflowne, puissante armure du roi dragon, Van....

Junkers Come Here suit l'histoire d'Hiromi Nozawa et de son chien Junkers. Alors qu'Hiromi plonge dans la solitude et la tristesse face au divorce de ses parents, Junkers essaye de la réconforter. En effet, Junkers n'est pas un chien comme les autres : doué de la parole, il lui accorde trois souhaits....

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Après qu'une expérience scientifique ait conduit à la création d'un clone de Mewtwo, il entreprend de détruire le monde. Ash et ses amis décident alors de déjouer les plans diaboliques de Mewtwo......

Dans l'Archipel Orange situé tout au sud de Kanto, le Dresseur Gelardan a un plan sinistre : attraper les Pokémon légendaires Artikodin, Électhor et Sulfura dans le but de réveiller Lugia, le gardien des abysses… Lorsque Sacha et ses amis arrivent, les habitants de l'archipel lui demandent de partir à la recherche de 3 sphères élémentaires issues de différentes îles. Alors que le climat est extrêmement perturbé dans le monde entier, il devient évident que la capture du trio légendaire a déséquilibré la planète. Avec l'aide de Lugia, Sacha pourra-t-il trouver les sphères sacrées, rétablir l'équilibre originel et devenir l'Élu tant attendu par tous ?...

Pendant leur voyage, Sacha, Ondine et Pierre décident de laisser leurs Pokémon dans un centre de vacances. Sacha demande à Pikachu de faire attention à Togepi. Dès l'entrée, Pikachu se fait écraser par ses congénères, visiblement plus pressés que lui d'entrer....

Tout le groupe, fatigué, décide donc de faire une sieste afin de se retrouver après en pleine forme....

Dans une grande ville, à bord d'un ascenseur, Pikachu remarque un Pichu lui tirant la langue au loin, le Pokémon de Sacha fait de même. Une fois arrivés à destination, et alors qu'ils sortent tous leurs Pokémon, Sacha, Pierre et Ondine les laissent vaquer pendant qu'ils sont occupés à autre chose. Sur le toit d'un immeuble, les Pokémon du Pokégroupe s'amusent, Pikachu repère alors le Pichu vu plus tôt qui continue à se moquer de lui. Le Pichu moqueur est sur le point de tomber mais son frère le récupère, c'est alors au tour de Pikachu de se rattraper de justesse grâce au concours de Granivol et de Miaouss. Cette aventure fait que Pikachu arrive de l'autre côté de la rue et les Frères Pichu décident de l'aider à retrouver ses amis. Malgré leur connaissance de la ville, les petits Pokémon Électrique attirent plein d'ennui à Pikachu durant le trajet. Ils rencontrent un Malosse qui n'apprécie pas de se voir atterrir dessus. Les Pichu attaquent le Pokémon Feu mais s'électrisent eux-mêmes....

Une catastrophe de cristal s'attaque à Greenfield... Sacha, Pikachu et leurs amis doivent trouver une solution pour réparer les dégâts causés à cette ville jadis si élégante. Mais l'impensable se produit quand la mère de Sacha est enlevée par le puissant Entei, un Pokémon qui était censé n'exister qu'en légende... Sacha doit partir à sa rescousse, sans savoir ce que cachent réellement ces événements incroyables : une jeune fille dont le rêve est transformé en cauchemar par des Zarbi mystérieux et inarrêtables....

En sauvant Celebi, le Pokémon légendaire qui peut voyager dans le temps, des griffes d'un braconnier, le jeune Sammy est projeté dans le futur, à l'époque de Sacha et co. Avec l'aide de ses derniers, il part à la recherche du Pokémon fée pour pouvoir rentrer chez lui, mais c'est sans compter sur la présence d'un célèbre braconnier de la Team Rocket qui est lui aussi sur les traces du Pokémon temporel....

Sacha, Pikachu et leurs amis Pokémon tentent de mettre fin aux agissements de deux bandits qui se cachent à Alto Mare, une ville constituée d'eau. Se joignent à l'aventure deux nouveaux Pokémon, un frère et une sœur se nommant Latios et Latias....

Mewtwo vit avec les pokémons clones dans lieu magique et préservé des humains de la région de Johto. Mais Giovanni est sur le point de le retrouver....

Dans ce film special "10 ans de Pokemon", le docteur Yung a mis au point un systeme qui lui permet de recreer n'importe quel Pokemon ayant existe grace a une technologie generant des "Pokemon Mirages". Sacha et ses amis sont invites a decouvrir l'invention dans un chateau ... mais ce qu'ils vont decouvrir est bien pire qu'ils ne l'imaginaient....

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Un jour de décembre, le gouverneur Asakura, qui a été réélu comme Gouverneur de Tokyo, reçoit une mystérieuse lettre d'avertissement. Celle-ci menace de faire sauter le tout nouveau tunnel souterrain municipal qu'il doit inaugurer le lendemain. Heureusement, Conan en entend parler par Kogoro, et en voyant une mystérieuse personne dans le tunnel, il arrive à prévenir les passagers du train et il n'y a aucune victime après l'explosion de plusieurs bombes. La police a beaucoup de mal à désigner un suspect, mais une autre construction initiée par Asakura est menacée. Qui est le poseur de bombes et l'assassin d'Hikawa ? Qu'est-il vraiment arrivé au fils de Fuyumi ? Conan et les détectives boys veulent résoudre ces mystères, mais attention ! Quelqu'un les suit à la trace, et en montagne, si on reste quinze minutes sous une avalanche, on meurt ! De nombreux dangers les attendent ! Sauront-ils les surmonter ?...

La petite Miko, âgée de 6 ans, a perdu son chien Papadoll. Un jour, Miko aperçoit un chat tout habillé, qui tente de passer inaperçu. Il va mener la fillette et son grand-frère jusqu’à Bampalwitt, le pays des chats…...

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